Una de las canciones más controvertidas e icónicas de Jackson, «They Don’t Care About Us», estuvo acompañada de un vídeo musical igualmente provocativo, dirigido por el cineasta Spike Lee.
Organizar y filmar el vídeo, lanzado en 1996, fue un proceso extenso. Las autoridades estatales originalmente intentaron prohibir a Jackson filmar en Salvador y Río de Janeiro, Brasil, por temor a que las representaciones de la pobreza pudieran afectar la tasa de turismo del país, y acusaron a Jackson de explotar a los pobres.
Un juez prohibió a Jackson filmar, pero el fallo finalmente fue anulado por una orden judicial. Si bien el gobierno se mostró reacio a permitir que Jackson filmara en Brasil, los residentes parecían más abiertos a la idea. Un fan de la vida real irrumpió en el rodaje y abrazó a Jackson, provocando que se cayera, pero el incidente apareció en el vídeo musical.
Por primera vez en su carrera, Jackson hizo un segundo video musical para un sencillo, esta vez filmando en una prisión con sus compañeros de celda. La segunda edición contiene imágenes reales de policías atacando a afroamericanos, la represión militar de las protestas en la plaza de Tiananmen, el Ku Klux Klan, el intento de asesinato de George Wallace y otros casos de abuso de derechos humanos.
En 2020, Lee creó un tercer vídeo musical que incorporaba partes de la versión de Brasil y de la prisión, junto con imágenes de las protestas nacionales de Black Lives Matter y una vista aérea de Black Lives Matter Plaza de Washington DC.
Antes de eso, Jackson dirigió el vídeo musical de «This Is It», que se lanzó después de la muerte de Jackson en 2009. El vídeo musical, de casi cinco minutos de duración, presentaba varias escenas de la ciudad natal de Jackson y su antigua residencia en Gary, Indiana, junto con fotografías y vídeos de él y tributos de sus fans de todo el mundo.
